1864년 5월 북군은 새 총사령관 그랜트 장군의 지휘 아래 대공세를 개시하였다. 서부전선에서는 셔먼 장군 지휘하의 북군이 채터누가에서 애틀랜타로 전진하여 포위작전과 우회작전을 전개하면서 시내로 통하는 철도선로를 확보하여, 열세에 몰린 남군을 후퇴시키고 9월 3일 애틀랜타를 점령하였다. 이어 11월 대서양을 향하여 애틀랜타에서 다시 진격을 개시한 셔먼 장군 휘하의 부대는 12월 20일 마침내 해안도시 서배너를 함락시켰다. 또한 셔먼은 여기에서 북상하여 그랜트의 공세를 돕게 된다.
동부전선에서는 그랜트가 남군의 주력인 리 지휘하의 노스버지니아 군단을 섬멸하기 위한 공세를 개시하였다. 5월 5일의 윌더니스전투로 시작하여 약 1개월간 거의 하루도 거르지 않고 전투를 계속한 끝에 피터즈버그에 포진한 남군을 포위한지 9개월만인 1865년 4월 그랜트는 마침내 남군전선을 돌파하는 한편 파이브폭스에서의 측면공략에도 성공하였다. 전사자와 도망병 때문에 2만 5000명으로 약화된 노스버지니아 군단이 서쪽으로의 퇴로마저 차단되자 리는 더 이상의 저항이 부질 없음을 깨닫게 되었다. 최후의 책임을 완수하기 위해 항복하기로 결심한 리는 그랜트에게 편지를 보내어 회견을 요청하였다. 4월 9일 애퍼매턱스 코트하우스에서 양군의 최고사령관인 그랜트와 리의 회견이 이루어져, 4월 12일 남군의 항복이 정식으로 인정됨으로써 전쟁은 끝났다.

전쟁은 예상외로 장기화한 데다가 그 양상은 대단히 심각하고 격렬한 것이었다. 남북 쌍방이 입은 인명피해는 막대하여 북부는 총동원수 200만 명 가운데 전사자 36만명, 남부는 60∼70만명 가운데 전사자 25만여명으로 추정되었다. 패배한 남부는 여러 면에서 커다란 타격을 입었다. 남부의 대부분은 전화(戰禍)로 황폐화되고, 1863년 1월 1일 발표된 노예해방선언으로 그 전통적 경제구조는 근본적으로 무너졌으며, 공업면에서 앞선 북부의 식민지적 입장에 놓이게 되었다.
1863년 11월19일 남.북간의 참혹한 전투가 벌어진 게티즈버그의 전몰 장병들을 추모하는 식전에서 링컨 대통령은 민주주의 역사에 길이 남을 만한 연설을 하게된다. 훗날 민주주의 정의로 널리 사용되는 “인민의, 인민에 의한, 인민을 위한 정부를 지상에서 소멸하지 않도록 하는 것”을 언급했다.